نمونه‌های حاوی پروتئین که برای الکتروفورز مناسب هستند، شامل سرم، ادرار تغلیظ شده و مایع مغزی نخاعی تغلیظ شده می باشند.

نمونه‌ها روی یک ژل اعمال می‌شوند و پروتئین‌های موجود در نمونه، بر اساس بار و اندازه، به صورت نوارهای مجزا جدا می‌شوند.

پس از جدا شدن باندهای پروتئینی، ژل رنگ‌آمیزی می‌شود و غلظت نسبی نوارها با چگالی سنجی تعیین می‌گردد.

اگر پروتئین مونوکلونال در نمونه شناسایی شود، نمونه‌ برای شناسایی آن پروتئین خاص در غلظت بالا تحت آزمایشات بیشتری قرار می‌گیرد. این نگرانی وجود دارد که تولید بیش از حد آنتی‌بادی با اختلالی مانند مولتیپل میلوما مرتبط باشد.