تست‌های غربالگری نوزادان و روش‌های مورد استفاده برای آزمایش‌ها از حوزه‌ای به حوزه دیگر متفاوت است.

به‌طور کلی 24 ساعت پس از تولد، از پاشنه نوزاد خون کامل گرفته می‌شود.

خون به صورت چند قطره بر روی یک کارت قرار می‌‌گیرد که هر قطره برای آزمایش غربالگری متفاوت در نظر گرفته شده است.

ترکیباتی که باید اندازه‌گیری شوند مربوط به بیماری‌هایی هستند که نوزاد به‌دلیل آن غربالگری می‌شود. این ترکیبات از لکه خون روی کاغذ استخراج می‌شوند و سپس با کروماتوگرافی مایع به روش نشان‌داده‌ شده جدا می‌شود.

برای شناسایی و اندازه‌گیری کمی ترکیبات مورد نظر می‌توان از طیف سنج جرمی استفاده کرد. اگر نمونه‌های خونی حاوی ترکیبات در غلظت‌های غیر طبیعی باشد، آزمایش غربالگری نوزاد مثبت می‌شود. در این شرایط ارزیابی بیشتری برای تعیین دقیق بیماری نیاز خواهد بود.