کروماتوگرافی شامل جداسازی ترکیبات با روش‌های مختلف است.

جداسازی را می‌توان با فازهای پایدار مختلف انجام داد، که ترکیبات به آن متصل می‌شوند و سپس از آن آزاد می‌شوند.

جداسازی را می‌توان با فازهای متحرک مختلف نیز انجام داد که ترکیبات را با فشار به سمت فاز پایدار هدایت می کنند.

در کروماتوگرافی گازی، گاز املاح را از طریق یک ستون هدایت می‌کند که در آن ترکیبات فرار  متصل شده و با افزایش دمای داخل سیستم جدا می‌شوند.

جداسازی ترکیبات در ستون بستگی به میزان فرار بودن  هر یک از ترکیبات دارد که مربوط به جرم، بار و یا ساختار هر ترکیب است.

برای جمع‌آوری ترکیباتی که نیاز به اندازه‌گیری دارند، ابتدا باید این ترکیبات را از یک نمونه مایع یا جامد استخراج کرد. ماده‌ای که به ستون تزریق می‌شود در واقع همان عصاره‌ی استخراج شده حاوی ترکیبات است.

دستگاه تشخیصی که برای اندازه‌گیری ترکیبات خارج شده از ستون‌ها استفاده می‌شود، بستگی به آن چیزی دارد که باید آزمایش شود.

این دستگاه می‌تواند طیف‌سنج جرمی، آشکارساز یونیزاسیون شعله‌ای و دستگاه جذب الکترون باشد.