کریستال‌های ایندیناویر در رسوب ادرار به کمک میکروسکوپ نوری به راحتی دیده می‌شوند. تقریبا ۲۰ درصد دوز خوراکی این دارو در طول ۸ ساعت بعد از مصرف خوراکی در ادرار دفع می‌شود، نیمی از آن به‌صورت ملکول دست نخورده و نیمی دیگر بصورت یکی و یا بیشتر از ۷ متابولیت شناخته شده‌ی آن مشاهده می‌شود. ایندیناویر در شرایط آزمایشگاهی در pH برابر ۶ یا بالاتر در آب نامحلول است. در زیر میکروسکوپ این کریستال‌ها به‌صورت کریستال‌های بیرنگ، قابل پولاریزه، مسطح که در دو انتها کمی باریک می‌شوند، دیده می‌شوند. این کریستال‌ها بندرت به‌صورت منفرد دیده می‌شوند و اغلب اوقات به‌صورت گروهی و به اشکال مختلف مشاهده می‌شوند.